1996年，在德州师专成立“生物信息学实验室”。承担了第一项山东省自然科学基金课题“DNA序列运作规律的数理研究”（Y95D1356），在Journal of Theoretical Biology 发表“Study on the Isentropic Equations of Nucleotide Sequences and Their Application”论文。

2004年，成立德州太阳app“太阳app在线”，完成山东省科技攻关课题“复合生物物理等技术促进淡水鱼生长及其机理的研究”。

2005年，成为“德州市太阳app在线”。与南京大学和中国科技大学联合承担国家自然科学基金重点课题“蛋白质和酶的折叠机制与其功能相关动力学”。

2006年，成为“山东省高校太阳app在线（筹）”，成立了由院士领衔的第一届学术委员会。

2008年顺利通过教育厅筹建阶段的验收。

2009年，获批为山东省首批研究生联合培养基地，与山东师范大学联合招收了首届生物物理方向硕士研究生。

2010年，获批“山东省功能大分子太阳app在线（省市共建培育基地）”立项建设，被评为“德州市首席专家岗位”，依托该平台获批“山东省生物物理重点学科”。研究成果“生物分子的物理特性研究”获山东省自然科学三等奖，是德州市首次获得该奖项。三年后，顺利通过山东省科技厅组织专家对省市共建培育基地的验收。

2012年，获批“山东省生物物理实验教学示范中心”、“山东省高校生物物理首席专家岗位”。依托该实验室，成立了“山东省物理学会生物物理专业委员会”。

2013年，成立了“德州市生物物理技术与生物制造协同创新中心”。组建了施蕴渝院士和陈润生院士为主任的实验室新一届学术委员会。聘任印第安纳大学教授周耀旗博士为实验室特聘教授。  

2014年，组织召开了“德州2014生物物理技术协同创新论坛”，实验室特聘教授周耀旗博士入选山东省泰山学者海外特聘教授。

2015年，获批山东省生物物理省级重点实验室立项建设，成为山东省开展生物物理多学科交叉研究的重要平台。

2016年，成立了“中国生物物理学会德州国家生物产业基地协同创新中心”。同年，实验室宋峰博士获批泰山学者青年专家。

2017年，实验室科研团队获批山东省黄大年生物物理创新团队, 打造了一支山东省开展BIO-X大交叉研究的重要团队。

2018年，杨跃东教授被评为“天衢英才”特聘教授。